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細(xì)菌基因組 DNA 提取試劑盒說(shuō)明書
點(diǎn)擊次數(shù):773 更新時(shí)間:2026-04-16
 

一、產(chǎn)品簡(jiǎn)介

本試劑盒由上海語(yǔ)燕生物出品,采用可以特異性結(jié)合 DNA 的離心吸附柱和緩沖液系統(tǒng),提取細(xì)菌基因組 DNA。離心吸附柱中采用的硅基質(zhì)材料為上海語(yǔ)燕生物新型材料,能夠高效專一吸附 DNA,可限度去除雜質(zhì)蛋白及細(xì)胞中其他有機(jī)化合物。提取的基因組 DNA 片段大,純度高,質(zhì)量穩(wěn)定可靠。使用本試劑盒提取的基因組 DNA 可用于各種常規(guī)操作,包括酶切、PCR、文庫(kù)構(gòu)建、Southern 雜交等實(shí)驗(yàn)。

二、產(chǎn)品規(guī)格

組份 50T 100T
RNase A 100μL×2 100μL×4
蛋白酶 K 1mL 1mL×2
溶液 A 15mL 30mL
溶液 B 15mL 30mL
漂洗液 15mL 15mL×2
洗脫液 10mL 20mL
吸附柱 50 個(gè) 100 個(gè)
收集管 50 個(gè) 100 個(gè)

三、保存條件

-20℃保存,有效期 12 個(gè)月。

四、產(chǎn)品使用方法(僅供參考)

(一)準(zhǔn)備工作

使用前請(qǐng)先在漂洗液中加入無(wú)水乙醇,加入體積請(qǐng)參照瓶體上的標(biāo)簽。所有離心步驟均為使用臺(tái)式離心機(jī)在室溫下離心。本試劑盒僅適用于革蘭氏陰性菌基因組提取,若用于革蘭氏陽(yáng)性菌基因組提取,需自備部分試劑或者選購(gòu) “R32717 革蘭氏陽(yáng)性菌基因組 DNA 提取試劑盒”。

(二)操作步驟

  1. 收集菌體:取細(xì)菌培養(yǎng)液 1 - 5mL,12000 rpm 離心 1 min.,盡量吸除上清。

  2. 菌體懸浮與 RNA 去除(革蘭氏陰性菌):向菌體中加入 250 μL 溶液 A,振蕩或用移液器吹打使菌體充分懸浮,向懸浮液中加入 40 μL 的 RNase A (10 mg/mL),振蕩 15sec,室溫放置 5 min。
    菌體懸浮與破壁(革蘭氏陽(yáng)性菌,額外步驟):如果是革蘭氏陽(yáng)性菌,可在第 2 步操作前加入溶菌酶溶液進(jìn)行破壁處理,溶菌酶及溶菌酶緩沖液需自備。具體方法為:向菌體加入 500uL 70% 乙醇,冰浴 20min,12000rpm 離心 1min,棄上清,菌體沉淀加入 110μL 溶菌酶的緩沖液(20mM Tris, pH8.0;2mM Na2 - EDTA;1.2% Triton X - 100)和 70μL 溶菌酶溶液(50 - 100mg/mL),37℃處理 30 - 60min。之后再進(jìn)行后續(xù)步驟。

  3. 蛋白酶 K 處理:向管中加入 20μL 的蛋白酶 K (10mg/mL),充分混勻,70℃放置 10 min,此時(shí)可見(jiàn)菌液呈清亮粘稠狀。

  4. 溶液 B 處理:向管中加入 220 μL 溶液 B,振蕩 15sec,70℃放置 10 min,瞬時(shí)離心以去除管蓋內(nèi)壁的水珠。

  5. 乙醇添加與混合:向管中加入 220 μL 無(wú)水乙醇,充分混勻,振蕩 15sec,溶液變清亮,此時(shí)還可能會(huì)出現(xiàn)絮狀沉淀,不影響 DNA 的提取,可將溶液和絮狀沉淀都加入到吸附柱中,靜置 2 min。

  6. 離心與棄廢液:12000 rpm 離心 2 min. 棄廢液,將吸附柱放入收集管中。

  7. 次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液 (使用前請(qǐng)先檢查是否己加入無(wú)水乙醇)。12000 rpm 離心 1 min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。

  8. 第二次漂洗:向吸附柱中加入 600μL 漂洗液。12000 rpm 離心 1 min,棄廢液,將吸附柱放入收集管中。

  9. 第三次漂洗:重復(fù)操作步驟 8。

  10. 去除殘余漂洗液:12000 rpm 離心 2 min,將吸附柱敞口置于室溫或 50℃溫箱放置數(shù)分鐘,目的是將吸附柱中殘余的漂洗液去除,否則漂洗液中的乙醇會(huì)影響后續(xù)實(shí)驗(yàn),如酶切、PCR 等。

  11. 洗脫液添加與室溫放置:將吸附柱放入一個(gè)干凈的離心管中,向吸附膜中央懸空滴加 50 - 200 μL 經(jīng) 65℃水浴預(yù)熱的洗脫液,室溫放置 5 min,12000 rpm 離心 1 min。

  12. 再次洗脫:離心所得洗脫液再加入吸附柱中,室溫放置 2 min ,12000 rpm 離心 2 min,即可得到高質(zhì)量的細(xì)菌基因組 DNA。

五、注意事項(xiàng)

  1. 樣品保存:樣品應(yīng)避免反復(fù)凍融,否則會(huì)導(dǎo)致提取的 DNA 片段較小且提取量下降。

  2. 溶液沉淀處理:若試劑盒中的溶液出現(xiàn)沉淀,可在 65℃水浴中重新溶解后再使用,不影響提取效果。

  3. 離心堵塞處理:如果實(shí)驗(yàn)中的離心步驟出現(xiàn)柱子堵塞的情況,可適當(dāng)延長(zhǎng)離心時(shí)間。

  4. 洗脫條件:洗脫緩沖液的體積不少于 50 μL,體積過(guò)小會(huì)影響回收效率;洗脫液的 pH 值對(duì)洗脫效率也有影響,若需要用水做洗脫液應(yīng)保證其 pH 值在 8.0 左右 (可用 NaOH 將水的 pH 值調(diào)至此范圍),pH 值低于 7. 0 會(huì)降低洗脫效率。DNA 產(chǎn)物應(yīng)保存在 - 20℃,以防 DNA 降解。

  5. DNA 濃度及純度檢測(cè):得到的基因組 DNA 片段的大小與樣品保存時(shí)間、操作過(guò)程中的剪切力等因素有關(guān)?;厥盏玫降?DNA 片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度與純度。DNA 應(yīng)在 OD260 處有顯著吸收峰,OD260 值為 1.0 相當(dāng)于大約 50 μg/mL 雙鏈 DNA、40 μg/mL 單鏈 DNA。OD260/0D280 比值應(yīng)為 1.7 - 1.9,如果洗脫時(shí)不使用洗脫緩沖液,而使用去離子水,比值會(huì)偏低,因?yàn)?pH 值和離子存在會(huì)影響光吸收值,但并不表示純度低。

 

 

 
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